1、科属区别：军鱼是倒刺鲃属的，草鱼则是草鱼属的。

2、胡须区别：军鱼的嘴巴边有2对胡须，草鱼则没有。

3、养殖难度区别：军鱼更加难养，因为军鱼对周围的环境要求高，草鱼的适应性要更好一些。

4、别称区别：军鱼有砖鱼、青棍等别称，草鱼有皖鱼、油皖等别称。

5、食性区别：二者相比，草鱼的食性更偏向素食。