1、从目前来看，墨脱处于中印领土争议地区东段中方实际控制地区边界上，县城距离印方实际控制地区界限也就二十来公里。不过距离我国主张的合法边界为125公里。

2、墨脱县是雅鲁藏布江进入印度阿萨姆平原前，流经中国境内的最后一个县，境内的居民主要为门巴族和珞巴族，雅鲁藏布大峡谷主体段在该县境内，是西藏高原海拔最低，最温和，雨量最充沛，生态保存最完好的地方。