1、手机恢复出厂设置的话，有两种情况还是会存有病毒的，一种就是手机还有外界的存储设备（如手机内存卡）中，如果有病毒的话，恢复出厂设置是没办法处理的；

2、再就是如果病毒获取了手机的ROOT权限的话，恢复出厂设置也是没办法除掉手机中的病毒的。