1、毛燕和燕窝的区别在于品种不同。毛燕属于灰腰金丝燕产出的，燕窝属于雨燕目雨燕科的部分雨燕和金丝燕属的金丝燕所产出。

2、两者产地也有区别，毛燕主要是泰国、印尼以及马来西亚地区产出，而燕窝除此之外，还在广东、福建等地有产。