简并引物
2022-07-15 23:31:57 百科资料
简并引物是指代表编码单个氨基酸所有不同碱基序列可能性引物的混合物。PCR为了增加特异性,可以参考密码子使用表,根据不同生物的碱基使用偏好,减少简并性。简并度越低,产物特异性越强,设计引物时应尽量选择简并性小的氨基酸,并避免引物3'末端简并。
- 中文名称 简并引物;兼并引物
- 外文名称 Degenerate Primer
密码简并性表
氨基酸 密码子数 M、W 1 个;C、D、E、F、H、K、N、Q、Y 2个; I 3个; A、G、P、T、V 4个; L、R、S 6个
(注:选择使用的肽链最好避开有4~6个密码子的氨基酸)
核苷酸链中除出现正常的A、T、G、C四种碱基符号外还出现如R、Y、M、K等其它字母(其中R=A/G,Y=C/T,M=A/C,K=G/T,S=C/G,W= A/T,H= A/C/T,B= C/G/T,V=A/C/G, D=A/G /T,N=A/C/G/T)。
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