引物设计原理，是一种植物设计原理。

• 中文名称 引物设计原理
• 长度 寡核苷酸引物长度为 15~30bp
• Tm值 一般控制在 55~60℃
• (G+C)含量 比例一般为 40~60%

原理

　　1、 选择合适的靶序列:设计引物之前，必须分析待测靶序列的性质，选择高度保守、碱基分布均匀的区域进行引物设计。

　　2、 长度:一般来说，寡核苷酸引物长度为 15~30bp。

　　3、 Tm 值:引物的 Tm 值一般控制在 55~60℃，尽可能保证上下游引物的 Tm 值一致，一般不超过 2℃。若引物中的 G+C 含量相对偏低，则可以使引物长度稍长，而保证一定的退火温度。

　　4、 (G+C)含量:有效引物中(G+C)的比例一般为 40~60%。

　　5、 碱基的随机分布:引物中四种碱基的分布最好是随机的，不存在聚嘌呤和聚嘧啶，尤其在引物的 3'端不应超过 3 个连续的 G 或 C。

　　6、 引物自身:引物自身不存在连续 4 个碱基以上的互补序列，如回文结构，发夹结构等，否则会影响到引物与模板之间的复性结合，尤其避免 3'末端的互补。

设计流程

　　先进行序列下载，然后进行 同源性比较 ，最后进行引物设计筛选 。