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基因组文库

2022-07-06 04:02:32 百科资料

基因组文库是指将某生物的全部基因组DNA切割成一定长度的DNA 片段克隆到某种载体上而形成的集合。基因组文库根据DNA 来源又分为核基因组文库、叶绿体基因组文库及线粒体基因组文库。基因组文库构建时遗传信息供体是基因组DNA,因而无发育时期及组织器官特异性,在一个完全的基因组文库中包含着基因组DNA 上的所有编码区及非编码区序列的克隆; 生物有机体的每一个基因在文库中都有其克隆,该克隆的基因片段里包括着间隔序列,所以基因组文库可真实地显示基因组的全部结构信息。

基因组文库(Genomic Library)定义:把某种生物基因组的全部遗传信息通过克隆载体贮存在一个受体菌克隆子群体中,这个群体即为这种生物的基因组文库。

  • 中文名称 基因组文库
  • 外文名称 genomic library

定义

  用限制性核酸内切酶切割细胞的整个DNA,可以得到大量的DNA片段,然后将这些DNA片段与载体连接,再转移到细菌中去,让宿主菌长成后进行克隆。这样,每个克隆的细胞的载体上都包含有特定的基因组DNA片段,整个克隆群体就包含基因组的全部基因片段总和称为基因组文库。

文库最小值

  一个理想的基因组文库要有足够多的克隆子数,以保证所有的基因都在克隆子群体中。为了获得某种基因需要构建的基因组文库的最小值可按下面的经验公式估算:

  N=ln(1-P)/ln(1-f)

  公式中,N表示基因组文库必须的克隆子数;P表示文库中目的基因出现的频率,一般情况下,期望值为99%,即0.99;f是克隆的DNA片段平均大小与基因组大小的比值。

克隆载体

  常见的用于构建基因组文库的克隆载体有λ噬菌体克隆载体、cosmid克隆载体、BAC克隆载体、BIBAC克隆载体、PAC克隆载体和YAC克隆载体。

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