反密码子是在tRNA的三叶草形二级结构反密码臂的中部，可与mRNA中的三联体密码子形成碱基配对的三个相邻碱基。在蛋白质的合成中，起解读密码、将相应的氨基酸引入核糖体A和P位点的作用。

反密码子(anticodon):RNA链经过折叠，看上去像三叶草的叶形，其一端是携带氨基酸的部位，另一端有3个碱基。每个tRNA(transfer RNA)的这3个碱基可以与mRNA上的密码子互补配对，因而叫反密码子。 tRNA分子二级结构的反密码环中部的三个相邻核苷酸组成反密码子。它们与结合在核糖体上的mRNA中的核苷酸(密码子)根据碱基配对原则互补成对，因此在蛋白质合成过程中，携带特定氨基酸的tRNA凭借自身的反密码子识别mRNA上的密码子，把所携带的氨基酸掺入到多肽链的一定位置上。

• 中文名称 反密码子
• 外文名称 anticodon
• 位于 tRNA反密码环中部
• 来源 生物学
• 作用 蛋白质合成中，起解读密码、将特异的氨基酸引入合成位点的作用

　　anticodon中除有常见的4种碱基外还出现次黄嘌呤(I) 其可最大限度阅读mRNA上的信息，降低突变引起的误差。所以实际上反密码子少于61种。

　　在转移RNA反密码子环中的三个核苷酸的序列，在蛋白质合成中通过互补的碱基配对，这部分结合到信使RNA的特殊密码上。

　　已知一种tRNA只能携带一种氨基酸，这表明密码子与反密码子之间的配对还是十分严格的。但是，tRNA的反密码子如何才能与其相应的氨基酸之间建立起结构上的关联性呢?氨基酰tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase，简称aaRS)在tRNA氨基酸臂上所携带的氨基酸与反密码子之间架起了桥梁，酶具有很好的空间扩展能力与柔性。一般情况下，aaRS至少包含一个催化核心结构域(catalytic central domain, CCD)和一个结合反密码子的结构域(anticodon-binding domain, ABD)。tRNA的氨基酸接受茎(即3'-端CCA-OH)，在aaRS的催化下，与经ATP活化的氨基酸通过酯键结合。携带同一个氨基酸的所有tRNA(也称为同功tRNA)由相同的aaRS所催化，而每种酶通过若干特殊碱基来识别同工的tRNA。已知aaRS与呈L型的tRNA的内侧面广泛结合。