PCR引物设计的目的是为了找到一对合适的核苷酸片段，使其能有效地扩增模板DNA序列。引物的优劣直接关系到PCR的特异性与成功与否。

　　PCR引物的设计原则

　　1. 引物应用核酸系列保守区内设计并具有特异性。

　　2.产物不能形成二级结构。

　　3. 引物长度一般在15~30碱基之间。

　　4. G+C含量在40%~60%之间。

　　5. 碱基要随机分布。

　　6. 引物自身不能有连续4个碱基的互补。

　　7. 引物之间不能有连续4个碱基的互补。

　　8. 引物5′端可以修饰。

　　9. 引物3′端不可修饰。

　　10. 引物3′端要避开密码子的第3位。