金沟河位于沙湾县南部山区，交通便利，落差大，水头高，十分利于建设水电站项目。该项目的提出符合国务院关于印发《水利产业政策》以及《产业结构调整指导目录》（2005年本）。随着《国务院关于落实科学发展观加强环境保护的决定》的出台到修改后的节约能源法的通过，国家鼓励发展的七大领域，这些领域主要有：生物质能、太阳能和风能等可再生能源利用技术，小型水力发电，节能环保型的交通运输工具等。

《金沟河流域规划报告》于2004年通过了新疆水利厅审查，流域总体规划任务以水、土资源综合利用和生态环境建设为主，重点解决灌区缺水和防洪问题。该规划确定金沟河流域上游採用“一库八级”的开发方案，除第八级水电站为坝式开发外，其余均为引水式开发。金沟河二级水电站是流域规划推荐方案中的第二个梯级水电站，也是该流域水电开发的近期推荐工程之一。目前金沟河流域已建有红旗渠首、大南沟团结渠首及金沟河灌区引水渠首和第三、四、五级三个梯级电站。