指对核电工程项目自批准立项起至投入商业运行止全过程(包括前期工作、设计採购、设备製造、土建安装、调试等)和全方位(包括质量控制、进度控制、投资控制三大控制)的管理。项目管理的目标是儘可能少的投入，建成长期安全稳定、经济高效运行的核电厂。由于核电工程工期长、参与者多、接口複杂、协调量大，其项目管理是一个庞大、複杂的系统工程，管理的好坏关係到项目的成败。国际上的通常做法是，由业主自己或委託工程顾问公司(AE)或总承包给主供应商组织一个功能齐全的工程管理机构，负责归口核电项目管理。儘管不同的项目管理模式下业主、工程顾问公司和承包商之间的分工、职责有所不同，但在总体上其工程项目管理机构及功能分块大致上是相同的。一般都分设设计採购、现场施工、调试、契约管理、项目控制、质量保证等六个主要部门。其中前三个部门是按建设阶段来划分职能，并进行对口管理的，而后三个部门则对项目的三大控制进行监控，并贯穿全过程的各阶段。总而言之，工程项目管理的核心是要使工程质量、进度、投资处于受控状态以达到低投入、高产出的目的，即实现工程的三大控制是项目管理的关键。