圣诞节前夜，打工归来的少年池野朋生在家门口发现一名银髮少女倒在地上。名为丽奈的她顺势住在了朋生的家中。丽奈虽不谙世事，却对计算机知之甚详，似乎怀有某种秘密。然而几天之后，自称丽奈姊姊的少女现身、打算强行带走她。丽奈是军事企业Aegis公司最重要的程式设计师，并且是手握本国国防兵器的天才少女。随后为了逃离迫近的Aegis追兵，朋生和丽奈两人开始了漫无目的的潜逃——第三届讲谈社轻小说文库新人奖《大奖》得奖的生动、正统的boy meets girl现在开幕！