Linux恶意软体可能不会和你所熟悉的其他平台有着相同的恶意软体问题，但仍然存在一些问题让Linux管理员非常困扰。

Linux恶意软体问题都与rootkits相关。Linux恶意软体rootkit更改伺服器上的二进制，Linux恶意软体使用有后门的版本替换它们。

Linux恶意软体通过这些rootkits和系统档案检查器识别可能已经发生的损坏。

Linux恶意软体让你创建一个资料库，存储着所有档案的校验和。Linux恶意软体可以让你定期执行自动扫描，查找并报告任何更改。Linux恶意软体一旦确定需要监控的档案列表，多数工作其实已完成，Linux恶意软体只是在可能出现错误时提醒你。