2013年1月9日，中国校友会网正式发布《2013中国大学评价研究报告》，这是中国校友会网大学研究团队连续11年发布中国大学排行榜。北京大学问鼎2013中国大学排行榜600强榜首，清华大学屈居第二，复旦大学名列第三，浙江大学居第四，上海交通大学列第五。其中，北京大学连续8年蝉联中国大学杰出校友排行榜第一，清华大学卫冕2013中国造富大学排行榜冠军，“国科大”问鼎2013中国大学科学贡献排行榜榜首。华中科技大学武昌分校、华中科技大学文华学院和吉林大学珠海学院居2013中国独立学院排行榜前三甲；北京城市学院、湖南涉外经济学院和山东英才学院名列2013中国民办大学排行榜前三强。最令人关注的是，全国13所大学跻身校友捐赠“亿元俱乐部”，中国人民大学超越浙江大学，跃居2013中国大学校友捐赠排行榜第三；诺贝尔文学奖获得者莫言助力母校提升媒体关注度，北京师範大学上升4个名次，跃居2013中国最受媒体关注大学排行榜第五。报告指出，对比分析11年来中国大学高端办学指标，除2012年新成立的中国科学院大学外，北大清华“秒杀”其他任何大学。
1998年至2012年，清华大学共发表Nature和Science论文32篇，雄居全国高校首位
美国《科学》杂誌与英国《自然》杂誌是目前国际上最具代表性、知名度和权威性的综合性学术期刊，享有极高的学术声誉和世界影响力。《科学》和《自然》的共同特点是非常强调研究工作的原创性，因此两刊一直致力于发表世界各学科最前沿的科学研究成果。在《Nature》和《Science》杂誌发表的论文整体上可以代表当前世界科学研究的最高水平，它们刊发了绝大多数诺贝尔奖获得者（和平奖、经济学奖除外）的原创性论文。
《Nature》和《Science》杂誌受到世界各国广大科技工作者特别是高校基础研究人员的极大关注，对指导高校提高自主创新能力和学术水平有着重要的套用价值。多年来，我国高校科技工作者努力创造高水平的科研论文向两刊投稿，力图使中国的科研成果走向世界，扩大影响，取得了不小的成绩。中国校友会网“2013中国大学nature&science论文排行榜”是以1998年至2012年我国高校在《自然》和《科学》杂誌上以第一作者单位发表的论文数量为基础统计得出，是衡量高校知识创新贡献力的重要标尺，是反映我国高校基础研究能力与学术创造力的重要标誌。
报告显示，1998年至2012年，全国共有48所大学以第一作者单位在《Nature》和《Science》杂誌上发表191篇论文。其中清华大学发表Nature和Science论文全国最多，共32篇，雄居中国校友会网“2013中国大学nature&science论文排行榜”榜首，遥遥领先于其他大学，充分体现出清华大学雄厚的基础研究实力和一流学术研究水平。北京大学和中国科技大学17篇，并列第二；复旦大学15篇，居第四；西北大学10篇，列第五；南京大学9篇，列第六，中国农业大学8篇，列第七；上海交通大学6篇，居第八；浙江大学和厦门大学各5篇，并列第十。
名列中国校友会网2013中国大学nature&science论文排行榜前二十的其他大学依次是南京师範大学、云南大学、汕头大学、西南大学、吉林大学、瀋阳师範大学、华中科技大学、四川大学、北京林业大学和中国药科大学等院校，这些院校在《Nature》和《Science》上发表的论文数量均在2篇以上，另外同济大学、东南大学、南京信息工程大学、中国地质大学、西安交通大学和河海大学等17所院校各发表1篇。中国校友会网大学研究团队学术专家、中国民航大学党亚茹教授表示，我国高校以第1作者发表于《Nature》和《Science》上的论文数基本呈震荡上升趋势，2012年比2011年增加了10所院校，表明我国高校的基础研究能力与学术创造力明显增强。
4所高校Nature和Science论文被引频次超千次，北京大学被引次数全国最高
从我国大学在《Nature》和《Science》杂誌发表论文的被引次数来看，1998年至今，共有4所高校两刊论文被引频次超千次，被引百次以上的的高校有16所。其中，北京大学两刊论文被引频次最高，共被引2434次，高居全国高校首位，充分说明北京大学的国际学术影响力和业界认可程度；清华大学被引2221次，居第二；中国科技大学被引1943次，名列第三；厦门大学被引1486次，居全国第四；复旦大学被引1265次，列第五；汕头大学被引981次，居第六；南京师範大学被引795次，列第七；中国农业大学被引706次，居第八；上海交通大学被引680次，列第九；西北大学被引581次，位居第十。对比分析1998-2012年我国高校第1作者被引频次所占比重发现，各年所占比重呈先升后降态势，说明我国高下发表的nature和science论文影响力有下降趋势，值得重视。
第一作者篇均被引次数能够从一定程度上反映出该作者所在单位的科技影响力，篇均被引次数超过百次的院校共10所，其中，东南大学发表的nature和science论文篇均被引次数全国最高，有373次，其他大学依次分别是汕头大学（327次）、厦门大学（297次）、西南大学（225次）、南京师範大学（199次）、北京大学（143次）、中国科技大学（114次）、上海交通大学（113次）等院校。