学校实行校长负责制，主要领导如下所示：

南昌航大附属学校创办于1955年，当时只有初级国小複式教学班1个，学生十余人，教师2人，第一任负责人为汪慧观。此后几年中，教学规模逐渐扩大，师生人数逐渐增多。1960年起，增设国中班。1972年9月创办高中，其后20多年中，高中办办停停，并一度由普通高中改为职业高中，1995年9月，恢复办普通高中至今。

近半个世纪以来，经过附校几代师生员工的辛勤努力，学校经历了一个办学规模逐步扩大、师资力量逐步增强、办学条件逐步改善、教学质量逐步提高的发展过程。学校名称也几经改变，由初创时的“子弟国小”，到包括国小、中学部的“子弟学校”，文革时改名为“五七学校”，文革后又恢复为“子弟学校”，1984年改为“附属学校”。

附属学校创办于1955年，在各方面取得了一系列可喜的成绩，被南昌市西湖区授予“文明单位”称号，被南昌市教育局评为南昌市“创文明校园、塑文明形象”达标单位；附属学校的中考升重点率都达30%以上，特别2007年、2008年、2009年分别高50%、46.3%和52.8%，连续多年被市教委评为“中招工作先进单位”。学生参加全国、江西省、南昌市各类学科竞赛多次荣获一、二、三等奖。教师也有多人荣获省市优质课比赛一、二、三等奖。