2005年加入上海国际青年队效力。

2006年随队搬迁到西安，球队也更名为陕西浐灞

2008年被租借至陕西浐灞在中乙的卫星球队陕西四达。

2010年加盟大连阿尔滨，在2010年中国足球乙级联赛决赛对阵天津松江的比赛中一次製造点球一次破门得分，帮助球队2：0获胜，是球队夺冠的首功之臣。

2011年因为队内激烈的竞争而在赛季开始前被租借到中乙新军福建骏豪。

2012年，侯哲来到了刚刚组建的中乙新军湖北华凯尔,随着华凯尔晋级中甲联赛，创下了史无前例的三年随三支不同球队沖甲成功的中国足球纪录。

2013年夏，侯哲被深圳风鹏租借引进再度回到沖甲赛场。儘管一如既往拼尽全力屡有关键进球，但深圳风鹏未能沖甲成功，侯哲的“沖甲帽子戏法”未能延续。

2014年加盟中乙球队太原中优嘉怡，并夺得了当年的中乙亚军，再次帮助球队成功升入中甲。

2015年因太原中优嘉怡足球俱乐部资金原因从山西太原搬迁至内蒙古自治区呼和浩特市并更名为内蒙古中优足球俱乐部呼和浩特中优足球队，侯哲继续跟随球队征战中甲联赛。

2010年，21岁的侯哲帮助大连阿尔滨获得中乙联赛冠军，他在决赛中打进一球助攻一次。2011年，他被租借到福建骏豪，在附加赛中击败贵州。2012年他被租借到湖北华凯尔，帮助球队晋级中甲。2013年，他被租借到深圳风鹏，不过球队获得第三名没能晋级中甲。2014年，他来到了太原中优，并再次成功沖甲。帮助四个球队沖甲这个纪录在中国足球史上名列第一，在中国足球圈也有了属于他的专有辞彙——“侯哲定律”。