北京大学光华管理学院上海分院成立于2001年。校区三易其址：以最初位于虹桥路龙柏饭店的一座洋楼为发祥地，北大光华在沪地区的教育活动如火如荼地开展起来；2005年，学区乔迁新址，迁到位于虹桥路的虹桥商务大厦；经过光华人历经数年的不懈努力，上海新校区于2015年新年伊始正式迁至北外滩秦皇岛路。

2001年，北京大学光华管理学院正式在上海龙柏饭店建立了EMBA上海办公室，与北京本部同步开设高级工商管理硕士学位（EMBA）项目，并于11月迎来了首届上海EMBA特设班。

2002年11月，EMBA上海第一届公开班开学，汇聚了全国各地的56名各界精英校友。

2005年，随着项目的发展，上海分院的办公地址搬迁到了虹桥商务大厦，以更为舒适的学习空间和更加先进的硬体设施，帮助校友提高学习效率。

2014年，办公地址迁到了黄浦江畔的北外滩，与陆家嘴金融贸易区隔江而望。新校址无论是在选址还是内设上，都彰显了传统与现代相融合，历史积澱与繁华崛起相碰撞的独特魅力。迄今为止，上海分院已培养了700多名EMBA优秀校友，校友网路覆盖全国各地，各校友俱乐部也相应成立，如高尔夫球会、金融协会、户外俱乐部、亲子俱乐部等等，极大地丰富了校友及校友家人的业余生活，增强校友们对学院的归属感和社会责任感。同时，上海分院也在不断拓展和完善北京大学光华管理学院在华东地区的教育规划布局，将逐步开设其他项目课程。