数学与计算机科学学院的前身是数学系，是云南民族大学创办最早的理科系，于1978年7月开始招收数学专业本科生。1998年增设计算机科学与技术本科专业，并由数学系更名为数学与计算机科学系。2002年7月，数学与计算机科学系和学校计算中心合併，成立数学与计算机科学学院。现有在校本科生、硕士研究生近1000人。

学院下设数学与套用数学系、计算机系、信息与计算科学系、统计学系、计算机基础教学部、计算机实验教学中心、数学与信息科学研究所和软体工程研究所等教学、科研机构。

学院计算机实验教学中心为校级实验教学示範中心，数据处理与智慧型计算实验教学示範中心分别为校级实验教学示範中心和云南省实践能力提升工程建设项目。建有计算机网路、嵌入式系统、计算机组成原理、微机原理与接口技术、数字逻辑、电子电路、数学实验、多媒体技术、软体工程、资料库套用技术、计算机维修与维护、计算机基础、物联网工程等实验室和计算机软硬体开放实验室，实验室面积约2000平方米；建有云南省高校物联网套用技术重点实验室。

学院教师在非线性动力系统、函式逼近论及其套用、组合最最佳化、智慧型计算、软体工程和信息安全等领域积极开展研究，并取得了较突出的研究成果，在国内外学术刊物上发表了300余篇科研论文，每年被SCI、EI和ISTP收录30余篇。目前教师主持或完成科研项目共38项，其中国家级项目12项、省部级项目11项、地厅级项目15项。出版学术专着、教材12部。积极开展学术交流活动，举办了全国民族院校数学与计算机教学科研研讨会，第四届国际遥感技术套用大会等。