近年来参加了国家973项目“新一代生物催化与生物转化的科学基础”和“人工合成细胞工厂”等多项国家与省部级研究项目。现为国家973项目“化学品生物合成代谢网路的计算模拟与途径设计”子课题负责人。在国内外检索期刊上发表论文30余篇，其中SCI论文10余篇，申请国家发明专利10余项，译有《比较基因组学手册：原理与方法》一书。