2004年4月12日，工程开工。

2005年11月24日，全线铺轨贯通。

2006年4月25日，正式投入试运营。但由于铁路的后期工作以及进口原煤价格等种种原因，运煤专列一直未能如期开展运输业务。为使铁路儘快投入正常营运，取得一定的经济效益，经多方努力，2006年8月20日，运煤专列正式营运。

2008年8月20日10时，由内蒙古策克口岸发往甘肃省酒泉钢铁公司的首列正式运煤专用列车驶出策克站，标誌着嘉峪关―策克口岸运煤专用铁路正式通车。与东边的酒额铁路互补，与临哈铁路交汇于额济纳旗的额济纳站。嘉策铁路与临策铁路连线以化解临策铁路在煤价低迷背景下运量困难的形势。

嘉策铁路扩能改造工程，已完成策克站牵出线延长348米铺轨施工，完成额济纳西站延长既有货物线施工，完成鹰窝沟站剩余站舍基础及围墙砌筑、信号塔基础施工和连锁系统调试，已完成投资3148万元，完成投资额的53%。

嘉策铁路作为兰新、临哈两大国铁干线的联络通道，优势作用明显，现已成为蒙古国及内蒙古自治区煤炭南线运输的战略通道。嘉策铁路扩能改造不仅有助于推动煤炭经贸发展、增加政府税收，更有利于促进口岸贸易经济繁荣发展，提高额济纳铁路网运能，促进该旗物流周转集散贸易。嘉策铁路扩能改造工程总投资5954万元，建设规模及内容为：对策克站东牵出线进行延长，新增发线两条，对室内控制系统进行相应改造；额济纳西站延长既有货物线，新增发线两条，新建乘务员休息室，对室内相应电气控制设备进行改造；新建鹰窝沟车站，包括站前广场、房屋及相应电气、供电通讯设施的建设。