嘉善县疾病预防控制中心，前身是嘉善县卫生防疫站，由于卫生体制改革，于2002年4月将嘉善县卫生防疫站拆分成立嘉善县疾病预防控制中心及嘉善县卫生监督所。

嘉善县疾病预防控制中心是全县公共卫生服务和疾病预防控制的业务技术指导机构。承担着全县急慢性传染病管理、儿童免疫规划管理、除四害技术指导、地方病和慢性非传染性疾病管理、学校学生常见病防治、健康教育和健康促进、部分食品、公共场所卫生等从业人员健康体检、卫生监督检验和委託检验等工作任务。

中心核定人员编制人数40名，目前现有在编人员30人，其中卫技人员27人，大学以上学历21人，中级职称13人。目前中心设一室四科：办公室、健康教育科、传染病防制科、地方病及慢性非传染性疾病防治科（预防保健门诊）、检验检测科（质量管理办公室）。

中心实验室现有萤光实时PCR、细菌鉴定仪、气相色谱仪、气相色谱质谱仪、液相色谱仪、离子色谱仪、原子吸收分光光度计、原子萤光光度计等各类仪器设备200件，其中万元以上仪器46件，通过计量认证的检测参数为157项。

机构名称:中心办公室
工作人员:6人
主要工作职责:协助中心党政领导做好党建行政管理、人事、财务、责任指导团队管理、突发公共卫生事件管理、科研教育培训、信息、绩效考核、效能建设、总务、后勤、网路维护等工作。

机构名称:健康教育科
工作人员:2人
主要工作职责:以“全民健康促进行动”为载体，开展各类宣传谘询活动、为社区卫生服务机构提供健康教育视频资料；组织开展《公民健康素养》巡讲活动、指导申报健康促进学校、承担全县健康教育工作。

机构名称:传染病防制科
工作人员:7名
主要工作职责:负责急性传染病卫生应急，做好应急技术和物资储备及风险评估；指导医疗机构开展传染病疫情监测，规範处置常见和新发传染病；负责全县免疫规划管理工作，指导接种门诊规範开展门诊创建、日常预防接种、查漏补种等工作，规範处置疫苗针对性传染病；完成医疗机构和托幼机构消毒质量检测任务，指导开展“四害”监测工作。

机构名称:地方病防制科
工作人员:3名
主要工作职责:承担着全县血吸虫病、疟疾、碘缺乏病等地方病的防控工作、负责落实各项防治政策和方案，掌握全县地方病流行情况，并对综合防治效果进行评价。

机构名称:卫生监测科
工作人员:2名
主要工作职责:承担食品安全风险监测採样工作，开展农村饮用水採样监测工作；负责食源性疾病、食物中毒的报告和流行病学调查；指导学校开展学生健康状况综合监测与学生常见病的预防控制工作。

机构名称:慢性非传染性疾病防制科
工作人员:3名
主要工作职责:承担着全县慢性非传染性疾病的防控工作、负责落实各项慢病防治政策和方案，进行辖区内高血压、糖尿病、肿瘤等慢病患病和死因监测，掌握全县慢病流行情况，并对综合防治效果进行评价。

机构名称:检验科
工作人员:11名
主要工作职责:承担全县突发公共卫生事件检验检测工作，开展常见健康影响因素、有毒有害因素及中毒事件的检测；开展常规微生物和寄生虫检测检验、病原学快速检测、病原学分离鉴定。

机构名称:爱滋病性病结核病防制科
工作人员:3名
主要工作职责:负责爱滋病的疫情监测，感染者和病人的管理、免费抗病毒治疗管理、高危干预工作、自愿谘询服务以及技术指导和培训；负责结核病的疫情监测、病人转诊和管理工作、免费治疗管理以及技术指导和培训。同时承担性病、麻风病的防制工作。