2005-06赛季，哈维·马丁内斯在奥萨苏纳队开始球员生涯，他在奥萨苏纳B队亮相出战低级别联赛。

2006年夏天，毕尔巴鄂竞技足球俱乐部以600万欧元将马丁内斯从奥萨苏纳足球俱乐部买进。2006-07赛季，马丁内斯加盟毕尔巴鄂竞技队的第一个赛季就为球队出场35次；2006年12月16日，在毕尔巴鄂主场与拉科鲁尼亚队的比赛中，马丁内斯独进两球帮助本队取胜。

2008-09赛季，马丁内斯为毕尔巴鄂竞技队在联赛中出场31次，打进4球，并在国王杯半决赛中打进关键球帮助毕尔巴鄂竞技时隔24年再度闯入决赛。

2012年8月29日，哈维·马丁内斯正式从毕尔巴鄂竞技转会至拜仁慕尼黑，与拜仁签订了一份到2017年6月30日的5年长约。其转会费为4000万欧元，这一身价打破了2009年马里奥·戈麦斯创造的3300万欧元的德甲转会费纪录。

2012年9月2日，在拜仁主场6-1战胜斯图加特的比赛中，马丁内斯在第77分钟替补巴斯蒂安·施魏因施泰格出场，完成自己在拜仁的首秀。11月24日，在拜仁主场5-0战胜汉诺瓦96的比赛中，马丁内斯用一脚倒钩射门，攻入自己在拜仁的处子球。在2012-13赛季的欧洲冠军联赛半决赛中，马丁内斯首发出场，最终帮助拜仁历史性地以两回合7-0的比分战胜巴塞隆纳，并在决赛中力克多特蒙德，取得了俱乐部的第5座欧冠奖盃。

2013年9月4日，马丁内斯成功接受了腹股沟手术，他是在拜仁队医沃尔法特的建议下接受手术的，意味着马丁内斯休战3周。

2014年8月14日，拜仁慕尼黑俱乐部官方宣布，在德国超级盃中受伤的马丁内斯十字韧带撕裂，飞赴美国进行手术，这直接导致马丁内斯的2014-15赛季提前报销。

2015年11月22日，在德甲第13轮沙尔克04主场对阵拜仁慕尼黑比赛中，马丁内斯在下半场头球破门帮助拜仁慕尼黑客场3-1战胜沙尔克04。11月29日，在德甲第14轮拜仁慕尼黑主场对阵柏林赫塔的比赛中，几乎踢遍中路前、中、后所有位置的马丁内斯当选全场最佳球员。12月18日，哈维·马丁内斯与拜仁慕尼黑续约至2021年。

2017年1月15日，在德国电信杯的冠军争夺战拜仁慕尼黑对阵美因茨的比赛中，马丁内斯在第11分钟，头球破门攻入致胜一球，帮助拜仁慕尼黑2-1击败美因茨夺得该届电信杯冠军。

2010年5月20日，马丁内斯入围了西班牙队征战南非世界盃的大名单，这是马丁内斯首次入选国家队，也是西班牙队出征南非世界盃23人名单中最小的球员。5月29日，在西班牙3-2击败沙乌地阿拉伯的热身赛中，马丁内斯在第81分钟时替补效力巴塞隆纳的哈维·埃尔南德兹·克雷乌斯，完成国家队的处子秀。6月3日，在西班牙以1-0的比分击败韩国的友谊赛中，马丁内斯首次首发上场。6月25日，在世界盃小组赛最后一场以2-1击败智利的赛事中，马丁内斯替补在70分钟时受伤的哈维·阿隆索出场。

2011年6月26日，哈维·马丁内斯作为西班牙U21国家队的队长，在丹麦U21欧青赛获得冠军。

2012年7月13日，主教练路易斯·米拉公布了西班牙国奥队参加伦敦奥运会男足比赛的18人最终名单，哈维·马丁内斯入选其中。在伦敦奥运会期间，哈维·马丁内斯担任西班牙国奥队队长，但球队没能够小组出线。

2014年5月31日，西班牙国家队公布了出征巴西世界盃的23人最终名单，哈维·马丁内斯入选其中。在巴西世界盃期间，马丁内斯只在西班牙对阵智利的比赛中获得出场机会。9月3日，西班牙官方足协公布西班牙队最新号码，而哈维·马丁内斯不在名单内，遭到落选。

哈维·马丁内斯的哥哥阿尔法罗·马丁内斯也是职业球员，效力于西班牙足球乙级联赛的埃巴队，司职中后卫。

2016年10月7日，马丁内斯和自己女友Aline Brum的儿子在慕尼黑出生，他们为这个小家伙取名叫卢卡，这也是马丁内斯第一次成为父亲。

马丁内斯是一个很好的选择，他可以打进攻、防守两个位置。马丁内斯对于巴萨几乎不需要适应，他没有语言障碍，和西班牙国脚有着很好的关係，更重要的是他对西甲联赛很熟悉，马丁内斯的风格更适和巴萨。（腾讯体育评）

哈维·马丁内斯，个人天赋极高，如其能拥有足够的比赛经验的话，那幺将会成为欧洲最好的球员之一。他可以在前锋身后作为一名位置很活的前腰或影锋，但他最擅长的位置还是在中场的中路作为攻防的枢纽，马丁内斯的抢断硬朗，传球準确。（搜狐体育评）

24岁的马丁内斯是西班牙当红国脚，身高达到1米90的他脚下技术出色，能司职后腰和中后卫，是不可多得的防守全才，此外他的传球和带球出击也深得西班牙足球的精髓。（《新闻晚报》评）