自1840年鸦片战争之后，清王朝一步步走向衰败，西方列强纷至沓来，他们贪婪地掠夺这个东方古国的资源与财富。与此同时，隔海相望的日本不再甘心于西方列强之后，也把觊觎的目光投向了贫弱落后的大清国，台湾岛成为了他们对华侵略的第一目标。就在日本觊觎我台湾宝岛的同时，西方列强之一的法国已经付诸行动了。
1884年（光绪十年），法国欲吞越南，进而夺我西南。清廷畏于压力，準备放弃安南，撤回镇南关外军队。而出身天地会的黑旗军首领刘永福，为保桑梓，拒不听旨撤兵，率领子弟兵大破法军。

闲曹小官唐景崧久叹用武无地报国无门，自告奋勇，要求去安南冒险传旨。然而当他目睹黑旗军战绩后，热血沸腾，抛弃了撤军使命，与刘永福并肩战斗。并说服两广总督张之洞，争取了军饷军械。一文一武同心协力，捷报频频。大捷谅山，力斩法军司令官安邺、李安国。
李鸿章怀有私心，匿捷不报，一意与法国媾和。朝廷上下不知安南真实情况，举棋难定。法国败于安南，组成无畏舰队进攻福建马江，马江水师尽丧。法军进而封锁台湾海峡，夺取了澎湖列岛。并欲攻占基隆，欲以作为筹码，逼清廷就範。退归林下的淮军老将刘铭传临危受命，毅然渡海。协调了在台湘淮各军，解除宿怨，同心对敌。使法军进奶退维谷。直至击毙法军总司令、海军中将孤拔，大获全胜。陆战海战，两线皆捷。
然而，当国大臣李鸿章却匿捷不报，反而有意夸大法国实力，渲染失败论调。促使朝廷仓皇签下不平等条约。使这场中法战争“不败而败”。引起朝野扼腕，壮士长叹。恭亲王为首的军机处成为替罪羊，“全班斥退”。代以年青好勇的醇亲王。清廷接受左宗棠、张之洞等封疆大吏建议，台湾建省，并以刘铭传为首任巡抚。唐景崧因功升任台湾道，成为仅次于巡抚的行政首长。而刘永福则率领黑旗弟兄改编的官军，担任南澳岛总兵。
南澳岛地处汕头海外，正处于台湾海峡的“喇叭口”。是广东唯一的海岛县。总兵辖广东营和福建营两营，负责澎湖列岛的治安。南澳岛上留有戚继光、郑成功等先贤的遗蹟。在清廷看来，这是苦差，又可防範刘永福的“反骨”。而刘永福却求仁得仁、以苦为乐。他与昔日战友唐景崧相约：你建台湾，我保台湾。
转眼十年。台湾已日新月异，百业俱兴。刘铭传却因老病而退仕回安徽故里。邵友濂继任。此时，北方风云大变。日本野心毕露，侵占清朝属国朝鲜后，得寸进尺。海陆两路进攻中国。身为直隶总督又兼北洋水师统帅的李鸿章一味保存实力，首鼠两端，把希望寄託于列强议和，终于使水师全军覆没。日军兵临城下，清廷无奈，只得派邵友濂赴日求和，又被拒绝。李鸿章则以全权大臣前往马关，签订了屈辱的卖国条约《马关条约》。除赔兵费两万万两白银，并割让辽东半岛和台湾全岛。讯息传来，群情激愤。台湾军民，誓死保台。
唐景崧正在继邵友濂代理台湾巡抚，举足轻重。由一介书生而为封疆大吏，更是弥足珍惜。他连连上书朝廷，要求收回成命。张之洞等大臣也极力进行外交斡旋，力保台湾。但是换来的只是朝廷每天的严旨申斥。“顾全大局，维持原议”。刘铭传要求回台保台，泣血而死。刘永福率军毅然渡台，“帮办台湾军务”。拥立唐景崧为总司令，反对割台，与日军决战。然而，这一对抗法的昔日战友，想法已经有别如天壤。唐景崧要保来之不易的官禄，只能唯朝命是从。他偷偷内渡，跑回大陆。而刘永福以疆土、百姓为重，不惧危命，团结台湾志士徐骧、林氏和广大同胞，坚决血战保台。他们寸土必争，处处为战，击毙了日本的阿部亲王。　
台湾沦陷了，但台湾人民抗击日军的斗争延续多年。回归祖国的信念一如既往。

该剧的编剧杨晓雄在这部作品中，用一年多的时间翻阅了大量史料，多次到广西、广东、山东、福建等地进行实地採风考察，在病榻上兢兢业业修改剧本，在完成该剧本的第三稿之后不久便病逝。

从2007年4月在福建横店正式开机至8月份拍摄结束，导演率领剧组在酷暑之中辗转广东、福建、北京、山东、广西等六地，儘可能在本剧所涉及的历史事件发生地进行实景拍摄剧组。

《台湾1895》比较全面地反映了历史现实，準确地把握了历史走向，生动形象地展示了台湾1873年到1895年的历史，具有很强的现实意义（台湾史研究专家张海鹏评）。该剧以近代中国遭受列强欺凌，清政府腐败无能、被迫割让台湾的屈辱历史为主线，以弘扬不屈不挠的爱国主义精神为主题，塑造了一批前赴后继、保家卫国的民族英雄形象。该剧实现了重大历史题材电视剧创作上的突破，具有很强的欣赏性。但也存在一些问题，如节奏可以进一步加快、有些台词不够準确等。（新华网评）

剧中李鸿章1874年说“八国联军刚刚火烧了圆明园”，而“八国联军事件”发生在1900年。另外，该剧的情节和人物设定都颇具争议。有观众提出对此类历史剧网开一面，但也有观众认为该剧硬伤太多不应再播。（南方日报评）