反式作用因子是转录模板上游的一类蛋白调节因子，包括激活因子和阻遏因子等，它们与顺式作用元件中的上游激活序列特异性结合，对真核生物基因的转录分别起促进和阻遏作用。
基本介绍
- 中文名：反式作用因子
- 外文名：trans-acting element
- 性质：蛋白质，多为转录因子
- 作用途径：另一基因的特异的顺式作用元件
概述
参与基因表达调控的因子, 它们与特异的靶基因的顺式元件结合起作用。编码反式作用因子的基因与被反式作用因子调控的靶序列(基因)不在同一染色体上。反式作用因子有两个重要的功能结构域:DNA结合结构域和转录活化结构域,它们是其发挥转录调控功能的必需结构，此外还包含有连线区。反式作用因子可被诱导合成, 其活性也受多种因素的调节。
结构
同一类序列特异性的反式作用因子由多基因家族所编码, 它们具有特定的蛋白质结构(如上述的锌指结构、硷性亮氨酸拉链、螺旋-环-螺旋基元等)和蛋白质结构上的同源性, 因而构成反式作用因子家族, 如类固醇激素受体家族、AP1家族等。
主要包括：
1.DNA结合域：
a.螺旋-转角-螺旋
b.锌指结构
c.亮氨酸拉链
d.螺旋-突环-螺旋
2.转录激活域：与其他转录因子相互作用的结构成分。常见的转录激活结构域有富含谷氨醯胺结构域，富含脯氨酸结构域及酸性α螺旋结构域
随着表观遗传学的发展，研究发现除了蛋白，DNA、RNA也有调控功能，所以现在也称反式调控元件，主要有miRNA，转录因子等
分类
①通用转录因子。普遍存在的转录因子，具有识别启动子元件功能的基本转录因子。
元件名称 | 共有序列 | 结合的蛋白因子名称 | 分子量 | 结合DNA长度 |
TATA box | TATAAAA | TBP | 30,000 | ~ 10bp |
GC box | GGGCGG | SP-1 | 105,000 | ~ 20bp |
CAAT box | GGCCAATCT | CTF/NF1 | 60,000 | ~ 22bp |
②组织特异性转录因子：与基因表达的组织特异性有很大关係，能识别增强子或沉默子的转录调节因子。
③诱导性反式作用因子：活性能被特异的诱导因子所诱导，不需要通过DNA-蛋白质相互作用就参与转录调控的共调解因子。
