公元3至7世纪建立了一些分散的王朝。13世纪末14世纪初爪哇形成强大的麻喏巴歇封建帝国。15世纪先后遭葡萄牙、西班牙和英国的入侵，1602年荷兰在印尼成立具有政府职权的“东印度公司”，开始长达300多年的殖民统治。1942年日本入侵，1945年日本投降后爆发8月革命，8月17日宣告独立，成立印度尼西亚共和国。

到1950年，全国分为：亚齐特区、北苏门答腊省、中苏门答腊省、南苏门答腊省、西爪哇省、中爪哇省、东爪哇省、小巽他省、加里曼丹省、苏拉威西省、马鲁古省、伊里安查亚省11省1特区。

1950: 日惹特别区设立，从中爪哇省分离；

1956: 加里曼丹省撤消，分为东加里曼丹省、南加里曼丹省、西加里曼丹省.

1957: 中苏门答腊省撤消，分为占碑省、寥内省和西苏门答腊省

雅加达首都特区设立，从西爪哇省分离；.

1958: 小巽他省撤消，分为巴厘省、西努沙登加拉省和东努沙登加拉省.

中加里曼丹省设立，从南加里曼丹省分离.

1960: 苏拉威西省撤消，分为南苏拉威西省和北苏拉威西省.

1964: 楠榜省设立，从南苏门答腊省分离;

中苏拉威西省设立，从北苏拉威西省分离;

东南苏拉威西省设立，从南苏拉威西省分离;

1967: 明古鲁省设立，从南苏门答腊省分离.

1971: 南苏拉威西省的省会望加锡更名为乌戎潘当Ujungpandang.

1976.7: 强并东帝汶民主共和国为东帝汶省.

1999.9: 北马鲁古省设立，系马鲁古省北部哈马黑拉等岛分立，首府德尔纳特市。

1999.11: 南苏拉威西省的省会乌戎潘当恢复1971年以前的名字望加锡。

2000.10: 万丹省设立，系西爪哇省分设，首府孔雀港（Pelabuhan Merak），暂住西冷。

2000.11: 邦加－勿里洞省设立， 由原属南苏门答腊省<?XML:NAMESPACE PREFIX = O />

的邦加岛、勿里洞岛等为其範围，首府邦加槟港。

2000.12: 哥伦打洛省设立，旧属北苏拉威西省，首府哥伦打洛。

2001.12: 伊里安查亚省更名为巴布亚省。

2002.1: 亚齐和巴布亚特殊自治法通过，亚齐特区的正式名称改为 Nanggroe Aceh Darussalam。

2002.5.20: 东帝汶省获得完全独立。

2002.9.24: 廖内群岛省设立，旧属廖内省，首府丹戎槟榔。

2003.11.14: 西伊里安查亚省正式成立。但在暴力抗议下，中和东两省还没有正式成立。

2004. 9.22: 印度尼西亚议会批准西苏拉威西省成立，分南苏拉威西省部分地区置。

印尼全国一半以上的人口集中在爪哇岛，在过去，印尼曾长期执行大爪哇沙文主义，其他族群对此深有怨言，激进的如东帝汶、亚齐、巴布亚则长期与爪哇武力对峙。最终东帝汶恢复主权独立。

亚齐：位于印尼最西端，扼马六甲海峡出口处，战略和贸易地位都很重要。这里直到1903年才被荷兰人征服。亚齐丰富的天然资源并没有使亚齐人民的生活水平得到根本改善，因为印尼独立后，特别是最近30年来，资源大部分都被中央政府垄断。加上亚齐人长期以来一直试图建立伊斯兰国家，这一地区分离活动不断。2005年8月雅加达与自由亚齐运动合解 ，这多半是处于海啸带来的积极意义。

廖内群岛：华人占有优势。印尼国会经过两年的讨论后，在2002年9月24日一致通过廖内群岛升格为印尼第31省的法案。廖内群岛共有1062个大小岛屿，人口约85万。它不但天然资源丰富，地理位置也十分重要 ，在马六甲海峡口，新加坡南。不过华人次等公民的身份还是没有彻底改变，华语也未获得公正自由发展的地位。

马鲁古：群岛上，穆斯林与基督徒人数相当。居住在马鲁古北部的穆斯林大都经商，生活比较富裕，而南部的基督徒则从事农业和渔业，生活比较贫困。在独立时期，荷兰人用马鲁古安汶基督徒对抗爪哇人和穆斯林。1949年荷兰人战败，安汶基督徒宣布成立“南马鲁古共和国”，次年被苏加诺军队打败。1999年马鲁古省最终南北分治为两省。

巴布亚：原是荷兰的殖民地，1961年获得独立。1963年印尼接管西伊里安，建立了伊里安查亚省。1969年8月联大决议，正式併入印尼。60年代开始，巴布亚独立组织从未停止活动。当地土着是美拉尼西亚人，其中99%信仰基督教。1998年巴布亚人均GDP仅次于雅加达和东加里曼丹。1999年爪哇将伊里安查亚省三分为西中东三省，但当地议会抵制了这个决议，并于2001年宣布改省名为巴布亚省。

根据2000年6月30日的人口普查值，印尼人口在50万以上的城市有18座，其中10座在100万以上，包括雅加达。

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