南云齐少时入选大连实德93/94年龄梯队。虽然身体上不占优势，但是南云齐的球感、速度远胜同年龄段的其它球员，身体素质使得大连实德的梯队教练甚至将他与郝海东和董方卓相比。

2009年10月，作为适龄球员，代表辽宁队参加了第十一届全运会。在辽宁队与上海队争夺4强名额的关键战役中，南云齐能突能射，搅得对方防线不得安宁。凭藉个人能力梅开二度，帮助辽宁队成功杀入半决赛。最终辽宁队获得第十一届全运会男子乙组季军。

2011赛季，进入大连实德一线队。2012赛季大连实德客场对阵贵州人和的足协杯比赛中南云齐首发出场完成了自己的成年队首秀，2012赛季中超联赛第三十轮大连实德主场0-3负于贵州人和的比赛中南云齐下半场替补出场，这也是到目前为止他在中超联赛中唯一一次亮相。

2013年，大连实德足球俱乐部被同城的阿尔滨集团收购，南云齐也随之加入了大连阿尔滨队。在2013赛季他被免费租借到中甲联赛的瀋阳瀋北队效力，在当赛季的中甲联赛中南云齐发挥出色代表瀋北队出场16次攻入4球。联赛第2轮，南云齐一脚世界波为瀋北队拿到第一个积分；联赛第3轮，首次首发的南云齐比赛尾声进球，瀋北队获得第一场胜利；联赛第4轮，南云齐首开纪录，瀋北队获得第一个主场的胜利。

2014赛季，南云齐在大连阿尔滨并没有获得过多的出场机会，基本都在预备队训练。

2015赛季，南云齐又被大连一方足球俱乐部租借至当时尚在中乙联赛的大连超越队，在2015赛季的中乙联赛中南云齐共为大连超越队出场19次攻入7球，是超越队沖甲的功勋之一。

2016年3月3日，中甲联赛升班马大连超越足球俱乐部正式宣布，与南云齐正式签约，契约期为三年，球衣号码为32号。南云齐由于上赛季租借效力于大连超越队，所以不占用转会名额。

2018年3月14日，南通支云官方宣布，大连千兆球员南云齐加盟球队，他将代表支云征战新赛季中乙联赛。

2008年，南云齐入选了中国国少队，成为国少队的主力前锋，在2008年亚少赛上对阵土库曼的比赛中打入一球。

速度够快、头脑冷静、接传射俱佳