本所承担多项国家、部委及省市级研究项目，继续承担国家基础科学人才培养-昆虫分类学特殊学科点的建设和人材培养任务。其中多项国家和省部级项目获得了奖励。主要集中于套用形态学、分子系统学、生物地理学等方法进行半翅目、双翅目及鳞翅目昆虫的分类学、分子系统发育、动物地理学和进化生物学的研究，同时还进行昆虫生理生化、昆虫病理学、害虫防治和昆虫与植物相互关係等方面的研究。现已出版专着多部，在国内、外期刊发表学术论文700余篇。