2012年2月，南通滨海园区成立。南通市委、市政府从市级机关抽调人员，与原通州区三余镇、通州区滨海园区、如东县大豫镇部分干部组成南通滨海园区开发建设指挥部。

2012年6月6日，南通沿海开发集团正式投入运营。南通沿海开发集团是由市政府授权市国资委履行出资人职责的市属一类企业，注册资本达30亿元，组建后主要从事投资和资产管理，参与通州湾的规划研究、招商引资，项目投入、基础设施建设等工作。

2012年6月6日，南通滨海园区港口发展有限公司揭牌成立。港发公司注册资本5亿元。其经营範围主要包括南通滨海园区範围内的滩涂围垦、港口码头等基础设施配套设施建设，港口岸线经营，货物装卸、物流、贸易经营等。该公司除了南通沿海开发集团公司、滨海园区控股公司两家国企股东外，还引进了南通一德实业公司、江苏韩通集团公司两家大型民营企业参股投资。

2012年8月1日，南通滨海园区腰沙围垦一期通道工程正式启动，标誌着通州湾大规模开发建设进入实质性阶段。该工程位于通州湾遥望港闸与东安新闸之间，南为三夹沙围垦区，北为冷家沙边滩，总长度约9500米，施工面积50公顷，工程造价约4亿元，预计明年6月底结束。

2012年8月8日，南通市人民政府与中国华电集团公司战略合作协定签约暨南通滨海园区通州湾项目筹备处揭牌仪式在江苏省南通市举行。中国华电集团公司副总经理陈飞虎、南通市市长张国华出席仪式并讲话。

2012年9月12日，南通滨海园区医院开工，总投资20亿元，滨海园区医院是园区内 首个社会事业项目，建成后将大大提升滨海园区及周边区域百姓医疗服务水平。

2012年12月21日，南通市政府与中国华电集团公司签署投资意向书，就华电在南通滨海园区投资建设2x1000MW超超临界清洁高效燃煤发电机组电力能源、燃机检修中心项目达成协定。华电通州湾电力能源和燃机检修中心项目分别占地1500亩和100亩，总投资321.5亿元人民币，一期投资81.2亿元人民币。电力能源项目位于腰沙围垦区，一期投资80亿元，计画在2015年2月开工建设；燃机检修中心项目位于启动南区春江路北，南海路东侧，一期投资1.2亿元，于2013年5月开工建设。

2013年6月24日，乔治海茵茨（江苏）飞机製造有限公司于在南通滨海园区组装的首架CH801HD型飞机成功试飞，25日又完成了CH750HD试飞成功。此次完成试飞成功的一共两架两个型号，分别为CH801HD，CH750HD，该项目总投资为5000万元，组装的飞机能在60米以内滑跑起降，这标誌着中国製造量产超短距飞机正式起飞。

2013年9月5日，中节能与南通滨海园区签署合作协定。此次双方就遥望港以北、334省道以南现有的风力发电场约1.2万亩的区域内，建设上有风力发电、中有光伏发电、下有水产养殖的风光渔业互补类型光伏发电项目，为园区的大开发、大发展作出贡献。此太阳能发现项目电场装机容量为400兆瓦，总投资约35亿元人民币。项目分三期建设，2014年年底前一期项目100兆瓦完成建设及併网。

2013年10月22日，总投资1.3亿元人民币的通州湾电子商务城项目与园区正式签约，该项目主要功能为电子商务、仓储物流、行销策划、电商谘询与服务等。

2013年11月22日，科教城项目一期工程于正式动工。一期工程包括：教学区5幢教学楼，1幢信息行政中心楼，一幢科技创业园大楼；共享生活区9幢宿舍楼，1栋商业餐饮中心；绿化、景观、操场、能源中心等配套设施。其中两幢教学楼，三幢宿舍楼，食堂与商场等配套设施工程将于年9月竣工交付。

2014年1月12日，林达集团董事长李晓林与园区管委会主任羌毅正式签订合作协定，江海外语文化生态体验城成功落户园区。江海外语文化生态体验城项目占地1500亩，总投资100亿元。体验城是集外语教育、旅游观光、商业物流、影视传媒“四位一体”的特色之城。

2014年4月8日，通州湾时代金融广场项目开工，投资5亿元，占地面积57亩，建设面积76000平方米，功能定位涵盖银行、保险、证券、投资、律师、审计、会计、评估的总部和营业部等各式服务机构，以及政府金融监管机构、政府监管培训机构，服务于园区金融事业的各种商务、会议、住宿、娱乐、休闲、餐饮等综合配套服务及设施，预计项目在2015年5月份能够初步投运。

2014年5月23日，三夹沙临港工业区区域建设用海规划海域使用论证报告书通过专家评审。

2014年6月，园区与上海中老年现代生活（国际）博览会组委会签署战略合作协定，正式拉开了园区中老年现代生活服务产业发展的序幕，战略合作协定约定合作双方将在中老年现代生活服务的职业培训、康复医疗、现代农业生态养老社区、久龄网研发中心等项目加强协作，利用各自优势形成互动共享。

2014年7月7日，市政府与上海海事大学签订战略合作协定，在港口、航运等领域开展深入交流合作，进一步提升南通江海资源科学高效开发水平。标誌着由南通着名实业家张謇创办的上海海事大学正式落户通州湾科教城。

2014年7月16日，州永邦投资有限公司与园区签署了南通滨海园区现代製造业产业园投资及建设合作框架协定，该协定的签署标誌着园区现代製造业产业园正式启动。

2014年7月，由江苏省可再生能源行业协会牵头，南通滨海园区管委会主办的通州湾海上新能源装备产业联盟在通州湾海上新能源装备产业园正式成立。该产业联盟由华能国际电力股份有限公司、江苏海上龙源风力发电有限公司、远景能源有限公司、江苏道达海上风电工程科技有限公司、国电联合动力技术有限公司、中国广核集团和华电重工集团共同发起，与通州湾新区共建高端装备製造业联合体，形成示範效应明显、创新能力较强、产业链完善的海上新能源装备产业园。

2014年8月28日，通州湾创业创新高校合作联盟成立大会在南通滨海园区成功召开，通州湾创业创新高校合作联盟在南通滨海园区正式揭牌。

2014年9月25日，国务院正式发布的《关于依託黄金水道推动长江经济带发展的指导意见》中明确提出：“推进通州湾江海联动开发”。

2015年3月12日，国家发改委复函江苏省政府同意设立通州湾江海联动开发示範区。努力把示範区建成长江经济带北翼桥头堡、江海联动现代物流集聚区、江海产业联动发展先导区、陆海统筹综合配套改革先行区。

2015年5月，江苏省委、省政府贯彻落实《丝绸之路经济带和21世纪海上丝绸之路建设战略规划》的实施方案中明确提出“推进南通建设通州湾江海联动开发示範区，建设通州湾江海联动国际物流中心和国际产业合作区”。

2012年3月20日，南通市政府发文确定南通滨海园区的规划控制範围，将通州区三余镇与如东县大豫镇部分区域、2014年9月10日海门的滨海工业园区及包场镇东灶港镇统一划归为南通滨海园区代管。

南通滨海园区（通州湾区域）代管範围总面积约585平方公里。其中，陆域部分约292平方公里（包括如东县大豫镇闸东村、东岗村、东凌社区行政区域範围，如东东安科技园区，东安闸内部分围垦区域，通州区三余镇全境、通州滨海新区）。海域部分0米线以上滩涂面积约293平方公里，主要包括腰沙-冷夹沙海域。远期规划控制总面积约820平方公里。

机场：园区距南通兴东机场50公里，约一小时车程。园区经崇启大桥至上海浦东机场156公里。

公路：平海大道东段已建成并进入园区，直通南通主城区的西段正在筹建中。平海大道全线贯通后，南通市区到南通滨海园区的车程将从1小时20分钟缩短到40分钟左右。南北方向穿越园区的临海高等级公路已开工建设，预计2013年底建成贯通。该路直接连线连云港、盐城、南通和上海。

规划中的扬启高速（扬州至启东）将穿过园区西部。

铁路：规划中的滨海城际轨道将连线市区和滨海园区，使园区到市区的交通更加快捷。规划中的沿海铁路穿过园区西部。

港口：园区将利用自身港口资源优势，开发建设港口群。园区北距连云港280海里、南距上海洋山深水港区120海里。

公交：园区现有通往南通市区的公交班车。园区管委会通往三余镇客运站的335路公车，现发车间隔为约一个半小时，规划中发车间隔缩短为半小时。

通州湾科教城由南通沿海开发集团有限公司投资建设，占地面积约5平方公里，总投资约120亿元。项目已于2013年11月22日正式打桩，计画于2014年9月，一期校区将正式启用。成功引进北航软体学院研究生院、河海大学研究生院、北京物资学院、上海海事大学研究生院、上海电力学院研究生院等高校落户，学生规模约有1万人；正在洽谈的北京外国语大学、中科院海洋所、上海交通大学、南京航空航天大学、香港理工大学、东南大学、浙江大学物流学院、南通职业大学等10余所高校已考察通州湾科教城，并形成了合作意向。预计到2020年，落户10所大学，10所科研院所，5所专业职业教育学校，5个高端产业孵化器及产业园，建成“集教育、培训、科研、产业、城市化于一体，融科研、科教、创新、创业为一身”的科教新城。

土地：南通滨海园区规划控制面积820平方公里，核心区规划面积585平方公里（其中陆域面积292平方公里、海域部分0米线以上滩涂面积293平方公里），核心区域包括如东大豫镇部分地区、如东东安科技园区、通州三余镇全境和原通州滨海新区。园区拥有建设用地面积可达400平方公里（含滩涂围垦区），全部可用于开发建设。拥有如此充裕的土地资源，在全国都是罕见的。

港口：南通滨海园区拥有通州湾这一优良建港区域。通州湾区域水深条件良好，南部小庙洪水道和中部三沙洪水道-10米等深线基本贯通，腰沙、冷家沙、三夹沙围填可形成近150公里的深水岸线。通州湾区域面积广阔，滩涂、水道相间，腰沙、冷家沙、三夹沙等大面积沙体经适当围填后，可形成超过400平方公里土地，全部可用于开发建设，不仅可谓规模化的港口及临港工业提供所需用地，而且可以为港口后方城镇建设提供广阔的发展空间。

据专家考证，南通滨海园区所在的通州湾是中国东部沿海地区不可多得的优良建港区域，园区腰沙和冷家沙区域具有150公里的深水岸线，可以规划建设100个5~10万吨级的码头，10个30万吨级的码头。目前正在开发建设的三夹沙将规划形成面积23平方公里、岸线长18公里的2~5万吨级的港口群。除物流功能外，其腹地主要建设大型石化、冶金、船舶修造、海洋重工基地，是长三角发展临港产业的首选之地。

滨海园区拥有南北两个海湾，北海湾生态环境优美，风光旖旎。依託小庙洪水道尾部形成的原生态天然海湾，一个 32平方公里的高品质、国家级生态海洋度假区正在建设中。沿着宽阔的经一路，一块块空地上都插上了项目告示牌，有温泉会所、度假别墅、观光农业等等。滨海园区旅游度假区从2012年底开始发展建设，分为六个功能区，包括康体养生区、滨海居住区、体育休闲区、综合功能区、文化民俗区和生态居住及战略储备区。南通滨海园区规划建设环保局局长顾学军告诉记者，为保护滨海生态，他们严禁污染企业进入，同时大力建设团结河景观带和人工湖、纳潮河生态景观工程，旅游度假区雏形基本形成。