中心现有工作用房约3500m2，其中卫生检验中心占1500m2，拥有原子吸收分光光度计（2台）、气相色谱仪（2台）、气-质联用仪、液相色谱仪、离子色谱仪、原子萤光仪、细菌鉴定仪、全自动生化仪、全自动血球计数仪、多功能显微镜等大型仪器和电子天平、酸度计、测汞仪、721分光光度计，流动X光车、应急车及劳动卫生、环境卫生现场检测先进仪器设备一批，并拥有百级、千级、万级净化检验室，已初步建立起疾病预防控制、卫生检验综合信息电脑网路管理系统、从业人员健康证管理系统、职工健康监护系统。中心现有在编职工76人，临工30人，硕士10人，本科47人，卫技人员95人，获得高级技术资格人员6人，中级技术资格人员35人。

南海区疾病预防控制中心主要职能：区疾病预防控制中心（卫生检验中心）在区卫生局及上级有关部门的领导下，负责辖区疾病预防控制具体工作的管理与组织。负责疾病预防控制、卫生监测检验、健康教育和健康促进、食品和公共场所从业人员体检与培训、卫生学评价等技术服务工作；承担传染病流行、公共突发事件和救灾防病等工作的调查；指导社区卫生服务和医院防保科开展防病工作，培训初级专业技术人员，协助和配合上级业务部门开展套用性科研和其它相关工作；承担全区皮肤、性病、结核病、精神病的防治工作。