南京博物院大遗址保护研究中心始终贯彻“开放、创新、联合、服务”的建设方针，围绕国家大遗址保护“十一五”规划的有关规定和中国东南地区大遗址的地域特点开展工作，对外承接与大遗址保护有关的考古调查勘探发掘、规划、保护以及展示项目。研究方向涵盖古建筑、规划、文物保护、考古、陈列展示、计算机等领域，成功开展了武进淹城遗址保护利用总体规划、无锡鸿山遗址博物馆越国贵族墓复原、徐州龟山汉墓墓道保护、绍兴印山越国王陵保护、浙江宁波田螺山遗址现场保护设计、徐州市狮子山汉兵马俑坑防水加固保护、杭州老虎洞南宋官窑窑址抢救性保护方案设计等大型项目。其中，无锡鸿山大遗址保护已被标榜为成功个案。将遗址保护与社区建设相结合，即城市休闲绿地模式，不仅实现了大遗址的保护，同时也做到了与周围环境的协调融合、社区居民的共存发展，真正实现了保护与利用的互相促进，协调发展。