河流生物指数（River Biological Index ，RBI），代表总分类单元数、ET分类单元数、香农多样性指数、水生昆虫分类单元数和优势分类单元%等5个指数，其值为累加5个生物指数后的总分值。

用多个生物指数共同参与评价水质时,由于不同生物指数有不同的量纲,难以得出一致的,简单明确的评价结果。Karr等提出的5,3,1生物指数记分法,根据每个生物指数值在一组参照点中的分布,对水质越好,值越高的指数,以25%分位数值作为划分清洁与轻污染的标準,高以此位点的值将给予最高分值5,对低于该值的分布範围进行均分,分别给予分值3和1;而污染越重,值越高的指数,以75%分位数值作为划分污染与非污染的标準,低于此位点的值将给予最高分值5,对高于该值的分布範围进行均分,分别给予分值3和1。由于每个指数的最高分值是5,最低分值是1,共有5个生物指数参与水质生物评价,因此,河流生物指数值可能的分布範围为5～ 25。採用四分法,将总分值的分布範围划成4个小区,每个小区对应一个水质级别,即河流生物指数划分4个水质级别的标準: 21～ 25,清洁;16～ 20,轻污染;11～ 15,中污染;5～ 10重污染

利用以往的多样性指数评价水质时,并不考虑底栖生物本身耐污能力的差异,尤其是耐污类群替代敏感类群的问题,使之对水质的评价结果有时优于实际状况。而用河流生物指数评价时,由于採用了多个生物指数,可从不同方面体现与水质的关係,结果更接近于实际状况。