反式互补效应是相邻基因座上功能互补的两个等位基因(此处以a和b表示)分别位于不同染色体上(反式:a+/+b)的现象。等位基因,又称对偶基因,是一些占据染色体的基因座的可以複製的脱氧核糖核酸。大部分时候是脱氧核糖核酸序列,有的时候也被用来形容非基因序列。
若一个染色体上的等位基因座位上的基因以两个以上的状态存在,便称为复等位基因。若成对的等位基因中两个成员完全相同,则该个体对此性状来说成为纯合子。若两个等位基因各不相同,则该个体对该性状来说是杂合子。在杂合子配对中,显性等位基因使隐性等位基因的性状得不到表现。某些成对基因的两个成员为共显性的,即彼此间没有显性和隐性的关係。