Solexa是一种基于边合成边测序技术(Seqeencing-by-Synthesis,SBS)的新型测序方法
核心技术
“DNA簇”和“可逆性末端终结”实现自动化样本製备及基因组数百万个硷基平行测序。
测序原理
Solexa 方法是利用单分子阵列测试 genotyping ,此种测序法首先是将 DNA 从细胞中提取,然后将其打断到约 100 - 200bp 大小,再将接头连线到片段上,经 PCR 扩增后製成 Library 。随后在含有接头的晶片( flow cell )上将已加入接头的 DNA 片段绑定在 flow cell 上,经反应,将不同片段扩增。在下一步反应中,四种萤光标记的染料套用边合成边测序( Sequencing By Synthesis )的原理,在每个循环过程里,萤光标记的核苷和聚合酶被加入到单分子阵列中。互补的核苷和核苷酸片断的第一个硷基配对,通过酶加入到引物上。多余的核苷被移走。这样每个单链 DNA 分子通过互补硷基的配对被延伸,利用生物发光蛋白,比如萤火虫的萤光素酶,可通过硷基加到引物后端时所释放出的焦磷酸盐来提供检测信号。针对每种硷基的特定波长的雷射激髮结合上的核苷的标记,这个标记会释放出萤光。萤光信号被 CCD 採集,CCD 快速扫描整个阵列检测特定的结合到每个片断上的硷基。通过上述的结合,检测可以重複几十个循环,这样就有可能决定核苷酸片断中的几十个硷基。
Solexa测序技术第二代分析系统Genome Analyzer IIx是当前世界上套用最为广泛的新一代测序系统,较当前普遍使用的一次只能读取1,000个左右的硷基,且DNA样品需要长时间的製备和分析的测序仪,具有高準确性、高通量、高灵敏度和低运行成本等突出优势。可以同时完成传统基因组学研究以及功能基因组学研究。为目前遗传分析和功能基因组等研究领域提出了全新的套用方案。
Genome Analyzer IIx测序读长为75×2 bp,每次运行数据量达14~18GB。对于4~5Mb的基因组,可确保每个基因组测序量达到400Mb(~100X覆盖),足以满足全基因组de novo测序和SNP鉴定的需要。
TBC已购置亚太地区第一台GA IIx测序仪,基于十余年基因组学研究经验及强大的生物信息学综合技术平台支持,为客户提供从制定研究计画到获得研究成果的全面解决方案。
Genome Analyzer IIx测序读长为75×2 bp,每次运行数据量达14~18GB。对于4~5Mb的基因组,可确保每个基因组测序量达到400Mb(~100X覆盖),足以满足全基因组de novo测序和SNP鉴定的需要。
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TBC服务内容
·基因组De novo测序
· 转录组测序
·全基因组重测序
·宏基因组测序
·小RNA测序
TBC服务承诺
1, 测序平均读长承诺50bp,每基因组测序量达100倍以上;
2, 全基因组精细图达到全基因组少于100个contigs,基因组覆盖度大于95%,基因区覆盖度达到98%以上,单硷基错误率低于十万分之一;
3, 完成图得到完整全基因组序列,无片段错拼和遗漏,单硷基错误率低于十万分之一;
4, 超高通量、高效率、高重複性、高準确率、低成本、完备的生物信息学分析和辅助研究,确保客户从研究计画到得到研究成果全过程的顺利进行。