杜仲橡胶资源是我国十分重要的国家战略储备资源。本研究首次在木本植物全基因组测序中结合第二代和第三代测序技术，攻克了杜仲基因组高杂合度、高重複所带来的组装困难问题；获得了大量杜仲橡胶合成途径中的功能基因家族；挖掘了大量杜仲药用万分相关的功能基因家族；揭示了杜仲适应性强的分子机制；揭示了杜仲的系统发育地位。研究成果将对颠覆性突破高产杜仲橡胶和现代中药育种技术、科学指导新型杜仲橡胶资源培育都具有十分重要的里程碑意义。

乌云塔娜，中国林业科学研究院经济林研究开发中心（国家林业局杜仲工程技术研究中心）教授，首席专家，博士生导师。

杜红岩，中国林业科学研究院经济林研究开发中心（国家林业局杜仲工程技术研究中心）副主任，研究员，博士生导师。

李芳东，中国林业科学研究院经济林研究开发中心（国家林业局杜仲工程技术研究中心）主任，研究员，博士生导师。

胡文臻，中国社会科学院社会发展研究中心副主任，中国社会科学院文化研究中心副主任，博士，副研究员，副教授，特约研究员。

高瑞文，山东贝隆杜仲生物工程有限公司董事长，教授级高级工程师。

汪德鹏，武汉未来组生物科技有限公司CEO。

一　杜仲基因组测序的重要意义/3

二　杜仲基因组测序主要研究成果/11

（一）突破了複杂基因组测序策略和组装方法/11

（二）解析了杜仲重要的功能基因/20

（三）揭示了杜仲不同环境广泛适应的分子基础/27

（四）揭示了杜仲种质资源的遗传多样性/31

三　杜仲基因组测序组装技术与方法创新/37

（一）第二代测序技术（Illumina）/38

（二）第三代测序技术（PacBio）/39

（三）杜仲基因组第二代、第三代测序混合组装/40

（四）杜仲基因组分析/41

参考文献/43