全基因组关联研究（Genome-Wide Association Studies，GWAS）是指在全基因组层面上，开展多中心、大样本、反覆验证的基因与疾病的关联研究，是通过对大规模的群体DNA样本进行全基因组高密度遗传标记（如SNP或CNV等）分型，从而寻找与複杂疾病相关的遗传因素的研究方法，全面揭示疾病发生、发展与治疗相关的遗传基因。

这一研究方法的引入，使对遗传流行病的发病预测不再停留在传统的年龄、家族史等“环境性”因素分析，而是通过对人体的全基因组的分析，找出可能导致今后发病的基因，并结合“环境性”因素，得出包括癌症在内的多种流行病的发病率。

以淋巴癌为例，目前国外已通过全基因组遗传流行病研究，找到超过20个可能导致这一病症的基因点位，如果人体的基因组符合这些特徵，并结合“种族”这一因素进行综合判断，该个体得淋巴癌的最高可能性将达52%。GWAS为全面系统研究複杂疾病的遗传因素掀开了新的一页，为我们了解人类複杂疾病的发病机制提供了更多的线索。目前，科学家已经在阿尔茨海默、乳腺癌、糖尿病、冠心病、肺癌、前列腺癌、肥胖、胃癌等一系列複杂疾病中进行了GWAS并找到疾病相关的易感基因。

我国科学家也在银屑病、精神病和冠心病等方面开展了GWAS研究并取得成效。如安徽医科大学张学军研究团队就处于GWAS研究的领先水平。