千年以来，酒见证中国人的生老病死，悲欢离合，三个兄弟的恩怨情仇，竞争角力，亦正围绕酒而开始。

梁家本为小康之家，过着乐也融融的生活，长子梁正尧在九江首富宋鼎天经营的酒坊“聚隆坊”打工，并深得鼎天信任，无奈二十年前的一场天灾，一遭人祸，竟彻底改写了梁、宋两家人的命运。

一场火灾，令正尧家园尽毁，举家流离失所；与此同时，宋家也遭逢船难，鼎天正室、二妾及两名女儿不幸遇害，独子宋子骏失蹤，只遗下幼女宋子澄和三妾丁家碧，鼎天大受打击，一病不起，临终前提出以付出大笔巨款，将正尧过继为宋家儿子，为他守护家业和抚养幼女子澄成人，正尧为了帮助家中渡过难关，也因为同情鼎天的遭遇，遂毅然答应鼎天，成为鼎天的过继子。

正尧成为聚隆坊的当家后，一直觊觎宋家家财的堂伯宋涛对他诸多留难，更诬衊其母关惠兰拿取宋家的金子，正尧为保惠兰的清白，忍痛当众和梁家划清界线，令祖父梁秋和二弟梁正匡认定他是个贪图富贵、冷血无情的忤逆子，愤然与他决裂，以后不相往还，正尧忍辱负重。

二十年后，正尧将酒坊经营得有声有色，更成为酒业商会主席。与此同时，正匡决意经营酒坊，正式开展酿製梁家酒的事业，欲证明自己可以白手兴家，出人头地，绝不逊于攀附富贵的兄长。惠兰为免兄弟二人成为竞争对手，劝谏正匡，可惜正匡一意孤行。

然而，一个人的出现，为宋家带来重大冲击，他就是失蹤了廿年的宋家长子子骏。正尧喜见子骏重返宋家，决用心栽培子骏，期望将酒坊大业早日交还给他，可是子骏对酒业毫无认识，一时未敢委以重任。子骏生性多疑，加上受到宋涛和贪官知县曾健梁(刘江饰)教唆，认定正尧有意独揽大权，对他充满敌意，令二人嫌隙日深。

宋家二小姐子澄天生长短脚，正尧受鼎天临危授命，努力为子澄物色可付託终身的好男人入赘宋家，于是安排相亲，却被正匡误打误撞破坏了，更让子澄的残障曝露于人前。婚事告吹的子澄，大受打击，竟离家出走，离开九江。时正匡因洽购酒庄一事出了岔子而要南下，二人在路上相遇。因缘际会，子澄竟因而重拾自信，更和正匡成为无所不谈的知己，二人不知不觉间，渐滋长出爱情，为梁、宋两家斗争埋下暗涌。

正匡、子澄恋情曝光，正匡不要子澄受委屈，向宋家提亲，子骏即大力阻挠，决不再容许多一个梁家人入侵宋家。而正尧亦质疑一直痛恨宋家的正匡对子澄的心意，对婚事有所保留，令子澄情义两难。为了不再加深三人的矛盾，子澄欲和正匡斩断情丝，更不惜顺从子骏的意思，下嫁另一酒庄少东。正尧终被二人真情打动，决以交出宋家当家之位作为交换条件，要子骏成全二人的婚事。

自此，子骏手握宋家大权，眼见正匡的梁家酒销路急升，并计画将酒外销，成绩有抛离宋家酒坊之势。子骏深深不忿，为了和正匡在商场上争逐，也有样学样，欲以外销酒发围。子骏将心意告知红颜知己曾郁芳(马赛饰)，而郁芳为助子骏梦想成真，向父亲健梁求助，让健梁为他疏通关卡，又以苛刻的条款向银号借得巨款，务求以高价抢购原料，準备大量外销宋家酒，夺取正匡的生意。

1、主角林保怡经营的聚龙坊其实是以有两百余年历史的广东省九江酒厂有限公司为原型。

2、九江酒厂之所以要赞助这部戏，原因是想宣传九江镇的历史。

3、《九江十二坊》是陈锦鸿与林保怡的首度合作，与钟嘉欣的第二次合作。

4、拍摄《九江十二坊》，每餐饭必定有酒。

以前TVB拍过酒类题材的《酒是故乡醇》，不过那一部比较具体讲怎幺做酒，而《九江十二坊》主要是通过九江镇上酒坊的竞争来讲兄弟、家庭的情感。（信息时报评）

林保怡对角色的拿捏十分到位，将大当家的“外冷内热”表现得很有层次。（羊城晚报评）

剧集播出后陈锦鸿夸张的演绎惹来了不少投诉，甚至被观众称为“咆哮鼻孔哥”。除了陈锦鸿的“咆哮”演绎外，剧中的配角演员也备受诟病。其中，曾在《点解阿sir系阿sir》中表现不俗的新人乐瞳此次饰演梁正匡的妹妹梁秀妍，每逢出场就瞪眼扯嗓子，那高八度的声线和一张臭脸让不少观众大呼崩溃，“哥哥是‘咆哮帝’，妹妹做了‘咆哮妹’。”（羊城晚报评）