沈家门第三国小以“现代化、高质量、有特色”为办学目标；以“文明、乐学、发展”为校风；以“求实、探索、奉献”为教风；以“博学、善思、明理”为学风。

建校62年来先后有20位校长为学校的发展呕心沥血。有200多名教师默默无闻育桃李芳天下，为高一级学校和社会输送了一大批合格人才。

60年前，由旅法归侨洪永川，向其义父南洋华侨富绅卢玉成募集办学经费6.4万银元，拟在沈家门办一所中学和国小，并要求命名“克昌”，以志纪念其先翁卢克昌。后因抗战爆发，存在上海银行之款被日寇冻结，在极其困难的条件下，只得借用天主堂余屋于1941年创办“沈家门私立克昌国小”，洪永川先生为校董，聘请天主教神父姚元中为校长。当年招生120名左右，设初小四个班，教学内容注重德、智、体，不教日文。开办后校誉斐然，学生逐年增加，成为六年制完全国小，至抗日战争胜利，学生已达300余名。1953年学校由人民政府接管，命名为“沈家门第三国小”，有班级8个，教师11名，学生340名。

抗战胜利后，设在荷叶湾羊府殿的鄞县东钱湖同乡会，为解决其渔民子弟入学，在羊府殿内开办了“私立鄞湖国小”，教师6名，学生160余人，开设1-4年级四个班，1953年改名为“沈家门第四国小”。1952年2月与沈家门第三国小合併，迁至荷外里坑马家祠堂为三小分部（1-3年级），三小为本部（4-6年级），（1958年8月——1959年7月）分部曾被命名为“沈家门第五国小”。 1959年8月两校合併为沈家门第三国小，全校共有19个班，900余名学生，24名教师。

1964年由上级拨款1.5万元，把在荷外里坑的原沈三小分部畚斗型旧平房拆除正中部分，改建成两层教学楼，计有8只教室，中间2只小办公室，留下东西两边旧房仍继续使用，直到2000年全部拆除。

1972年在国小基础上附设国中四个班，学生200名，1980年附中停办学生转入沈家门第二初级中学。1973年全校共有27个班，学生1500余名，教师近50名，因学校规模过大、校舍分散，把原沈三小分部马家祠堂的民办班、舟山水产公司子弟学校合併另立一校，命名“沈家门荷外国小”。附设国中班两个，学生100名，后国中停办学生转入沈家门第二初级中学。1983年原沈三小校址划给共青团普陀县委，兴建了普陀县青少年宫。是年由县政府拨款12万元，在荷外国小的后操场新建了四层教学大楼一幢，学校占地面积1267平方米，建筑面积1450平方米。1984年8月沈三小迁到荷外国小合併成为现在的沈家门第三国小。2000年由区、镇政府拨款250万元，动拆学校周围民房和拆除旧校舍，在原教学大楼西首新建了五层综合大楼（名曰海艺楼）。

学校现有建筑面积3343平方米，生均5.2平方米。校内有电脑室、语音室、多媒体教室，另有音、体、美、劳、图书阅览各室配套齐全，实现了校园计算机网路管理，为学校教育现代化创设了良好的条件。

在教育方针指引下，经过全校师生的共同努力，近几年来，先后获得省体育达标先进单位，市素质教育示範学校，市电化教育达标学校，市教师基本功训练先进集体，市示範性家长学校，市群体师德创优学校，区行风建设先进集体，五年来连续保持区级文明单位称号。教师、学生在全国、省、市级各级各类竞赛中获奖达130多人次，为学校赢得了荣誉。