昌吉学院外语系从1978年创办英语专业，1981年开始招收普通专科班，2000年开始招收普通本科班（与新疆师範大学联合办学），2001年开始招收昌吉学院首批本科生。

外语系现有副教授9人，讲师9人，助教11人，已获硕士学位的教师2人，在读研究生9人，常年聘用外籍教师3-4人，并聘请上海外国语大学、上海大学、新疆大学、新疆师範大学的5名教授为外语系客座教授，每年来外语系讲学或指导教学、科研等工作。