现代人类学教育部重点实验室依託复旦大学，实验室于2002年4月成立，2005年12月获教育部批准建设。

实验室以分子人类学为基础，辐射至生物人类学和文化人类学的各个领域，在横向、纵向、深向三方面拓展学科功能。在横向上研究中国、亚太和全世界的民族人群的遗传结构，探讨现代人起源和迁徙的过程以及民族形成和变迁的规律；在纵向上探讨人类的进化规律，同时研究各考古遗址的骨骼样品，对古代人群的遗传结构及其变迁构架出一个时空网路；在深向上分析各种人体形态的遗传结构和机理，探讨人体的演化；以及複杂疾病发病的分子机制和环境相互关係等。我们的重点是调查亚洲和太平洋地区的各个人群和民族，採集的大量样本涉及数百个群体的数万个体。这些样本的研究有助于理清亚太地区人群的源流。中国民族众多，语系繁複，人群迁徙过程複杂，有大量值得分子人类学手段研究的历史和民族问题。

近年来，我们在国内外期刊上发表了数十篇论文，其中包括《Science》和《Nature》等国际权威杂誌，经教育部批准设立了我国首个人类生物学博士点，并获得国家和省部级科技进步奖5个。